Первые поселенцы появились в здешних местах в 1930-х годах. Однако Няганские Юрты упоминались и в текстах конца XIX века. Встречаются они и в переписи 1926 года.
В 1954 году на реке Нягань-Юган был образован посёлок лесозаготовителей (ныне Старая Нягань). Объёмы лесозаготовок росли, и в 1965 году неподалёку был основан посёлок Нях.
1 октября 1966 года был образован Няганский леспромхоз.
В 1967 году до посёлка довели железную дорогу, по ней прошёл первый поезд с одним вагоном. Решением облисполкома образован Няхынский сельсовет.
В 1978 году была образована Красноленинская НефтеГазоРазведывательная Экспедиция (КНГРЭ), и вскоре была найдена промышленная нефть. Изначально добычей нефти и газа занималось объединение «КрасноленинскНефтеГаз», которое переросло в ОАО «Кондпетролеум». С 1999 года добычу ведёт ОАО ТНК-Нягань, переименованное в 2014 году в ОАО «РН-Няганьнефтегаз». В 2004 году объём добычи составил 4,5 млн тонн нефти. В 2006 году объём был равен шести миллионам тонн нефти.
15 августа 1985 года посёлку Нях был присвоен статус города с присвоением наименования Нягань.
С 2014 года градообразующим предприятием становится компания «РН-Няганьнефтегаз» (АО с 2015 года), принадлежащая НК «Роснефть».
